在河南大学110多年的发展历程中，农学研究与教育历史悠久，1927年河南公立农业专门学校与中州大学合并为国立第五中山大学（河南大学前身），1930年河南第一甲种农业学校并入，农科改为农学院。1952年，全国院系调整，河南大学农学院独立为河南农学院。王陵南、李先闻、郝象吾、王直青、王鸣歧、吴绍骙、刘潇然、涂治等诸位学者先后在农学院任教。

1987年，河南大学重建生物学科。2017年9月，生物学科入选世界“双一流”建设学科。生物学科以“逆境生物学与可持续农业”为优势特色，按照“顶天立地”的口径服务国家粮食安全战略。2020年12月，在服务国家重大战略需求和生物学科发展内生驱动下，河南大学恢复重建了农学院，基本定位为学科建设、科学研究、学生培养三位一体的研究型学院，为生物学“一流学科”两院两室（生命科学学院、农学院、棉花生物育种与综合利用全国重点实验室、省部共建作物逆境适应与改良国家重点实验室）的重要组成部分。

河南大学农学院立足黄淮海区域特色，面向国家粮食主战场，发挥综合性高校多学科优势，重点发展现代分子育种、智慧农业、营养健康及农业交叉学科，着力解决农业现代化发展中的重大关键问题，彰显办学特色。

学院汇聚了一批以国家杰青、教育部CJ学者、国家重点研发首席科学家为学术带头人，中青年教师为骨干的从事生物农业科研、教学和推广的高水平师资队伍。近年来，学院教师主持国家重点研发计划、国家重点研发计划青年科学家项目、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金委生物育种青年专项、河南省重大科技专项等项目，连续三年人均到账科研经费位居全校第一。学院与学科内其他单位错位发展，打造一流学科框架下服务国家粮食安全战略的重要平台，现已构建“1学院+4中心+3基地+2研究共同体”的良性发展柱基，大力推进农工、农理、农医等深度交叉融合与协同创新发展。